MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Novosphingobium sp. PP1Y plasmid Spl

Total Repeats: 134

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015582	GGC	2	6	677	682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015582	GCC	2	6	689	694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_015582	ATT	2	6	778	783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015582	AGCCAA	2	12	833	844	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015582	CT	3	6	891	896	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015582	GCA	2	6	1062	1067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015582	ATG	2	6	1192	1197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015582	AAAAG	2	10	1223	1232	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015582	CGG	2	6	1243	1248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015582	G	7	7	1273	1279	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015582	TA	3	6	1313	1318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015582	CGA	2	6	2307	2312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015582	CATGA	2	10	2326	2335	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_015582	GCG	2	6	2359	2364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015582	TGGA	2	8	2365	2372	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015582	GGACGG	2	12	2438	2449	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_015582	ACGGC	2	10	2460	2469	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_015582	CGA	2	6	2526	2531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015582	GCG	3	9	2547	2555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015582	GCC	2	6	2558	2563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_015582	CCTCCC	2	12	2594	2605	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
22	NC_015582	CG	3	6	2628	2633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_015582	GC	3	6	2640	2645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015582	CGG	2	6	2661	2666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015582	CTTC	2	8	2677	2684	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015582	CCG	2	6	2719	2724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_015582	C	6	6	2751	2756	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
28	NC_015582	CGGC	2	8	3226	3233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015582	GCG	2	6	3241	3246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015582	C	6	6	3265	3270	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
31	NC_015582	CTT	2	6	5109	5114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015582	TATG	2	8	11934	11941	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015582	CAT	2	6	11954	11959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015582	ATA	2	6	11982	11987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015582	ACC	2	6	13170	13175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_015582	ATG	2	6	13533	13538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015582	GGC	2	6	13545	13550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015582	AGGG	2	8	13573	13580	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015582	AGC	2	6	13609	13614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015582	TCA	2	6	13686	13691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015582	GAAG	2	8	13758	13765	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015582	TAT	2	6	13802	13807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015582	C	6	6	14806	14811	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
44	NC_015582	CCTT	2	8	14815	14822	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015582	GCG	2	6	14907	14912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015582	CTTCG	2	10	14923	14932	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_015582	A	7	7	15550	15556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015582	A	6	6	15585	15590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015582	GAA	2	6	15619	15624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015582	GAC	2	6	16680	16685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015582	CGGAA	2	10	17144	17153	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_015582	GAG	2	6	17400	17405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015582	CA	3	6	17765	17770	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_015582	GC	3	6	17821	17826	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_015582	TGA	2	6	18008	18013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015582	AAG	2	6	18660	18665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015582	GCG	3	9	18679	18687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015582	GGC	2	6	18711	18716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015582	TTC	2	6	18737	18742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015582	TCC	2	6	18750	18755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_015582	GC	3	6	18787	18792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015582	GCA	2	6	18814	18819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015582	GAG	2	6	24641	24646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015582	GCC	2	6	26430	26435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_015582	GTT	2	6	26465	26470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015582	TGG	2	6	27760	27765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015582	CAA	2	6	27808	27813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015582	GC	4	8	29665	29672	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015582	CG	3	6	33836	33841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_015582	GA	3	6	33844	33849	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015582	TGC	2	6	33864	33869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015582	GGC	3	9	33885	33893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015582	GCG	2	6	33895	33900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015582	CGC	2	6	33965	33970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_015582	GGC	2	6	34060	34065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015582	ATG	2	6	36218	36223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015582	TGG	2	6	39129	39134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015582	GGC	2	6	39142	39147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015582	GCG	2	6	39202	39207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015582	AGG	2	6	39215	39220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015582	CG	3	6	39224	39229	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_015582	GAC	2	6	39231	39236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015582	GA	3	6	39237	39242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015582	AT	3	6	41158	41163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015582	GTC	2	6	41174	41179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015582	TG	3	6	41289	41294	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015582	AAG	2	6	41295	41300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015582	GAA	2	6	41301	41306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015582	TG	3	6	41386	41391	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015582	CGGC	2	8	41880	41887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_015582	GCG	2	6	41900	41905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015582	GCCTT	2	10	41942	41951	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_015582	G	6	6	42703	42708	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015582	GGC	2	6	43216	43221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015582	CGTG	2	8	43857	43864	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_015582	CGT	2	6	44157	44162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015582	CTAT	2	8	44208	44215	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_015582	CATC	2	8	44220	44227	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_015582	CCTC	2	8	44846	44853	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
100	NC_015582	GC	3	6	44874	44879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_015582	ACGA	2	8	44929	44936	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_015582	TGC	2	6	44937	44942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015582	GC	3	6	44995	45000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_015582	GCG	2	6	45003	45008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015582	CGA	3	9	45013	45021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015582	ACG	2	6	45055	45060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_015582	TTC	2	6	45075	45080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015582	CGC	2	6	46036	46041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_015582	ATT	2	6	46115	46120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015582	AGCG	2	8	46995	47002	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_015582	TCG	2	6	47024	47029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015582	TGG	2	6	47041	47046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015582	TCA	2	6	47156	47161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015582	AAT	2	6	47641	47646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015582	GTT	2	6	47647	47652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015582	GCG	2	6	47670	47675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015582	ACGGC	2	10	48060	48069	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
118	NC_015582	CCGA	2	8	48087	48094	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_015582	GT	3	6	48099	48104	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015582	CTCG	2	8	48134	48141	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_015582	CGC	2	6	48149	48154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_015582	T	6	6	48172	48177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015582	G	6	6	48187	48192	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015582	C	6	6	48199	48204	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
125	NC_015582	CG	3	6	48230	48235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_015582	GC	3	6	48242	48247	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_015582	TCCCCC	2	12	48314	48325	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
128	NC_015582	C	7	7	48353	48359	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
129	NC_015582	CAAGAC	2	12	48441	48452	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015582	CGC	2	6	48457	48462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_015582	GC	3	6	48474	48479	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_015582	CT	3	6	48570	48575	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_015582	CG	3	6	48644	48649	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_015582	GCC	2	6	48685	48690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.